ASCO: AI

Immagine omica spaziale dal tessuto tumorale umano

Tra le grandi letture degli studi clinici presso ASCO, un nuovo progetto di ricerca ha fatto il suo debutto ufficiale con l'ambizioso obiettivo di mappare le interazioni delle cellule tumorali con il loro ambiente in una "risoluzione prossima alla singola cellula".

Il progetto – denominato MOSAIC (Multi Omic Spatial Atlas in Cancer) – riunisce una serie di organizzazioni accademiche di ricerca sul cancro, nonché la società di intelligenza artificiale Owkin, specializzata in modelli di apprendimento automatico utilizzati per trovare nuovi biomarcatori e bersagli terapeutici da campioni di pazienti e società di biologia spaziale NanoString.

MOSAIC sta iniziando la sua vita con un finanziamento di 50 milioni di dollari da parte di Owkin e utilizzerà una tecnica nota come "omica spaziale", che combina il sequenziamento dei geni con tecnologie di imaging per analizzare RNA e proteine ​​non solo per la loro presenza o quantità, ma anche dove sono fisicamente situati nelle cellule e nel microambiente in cui vivono.

Secondo il consorzio – che riunisce l’Università di Pittsburgh, Gustave Roussy, l’Ospedale universitario di Losanna, Uniklinikum Erlangen/Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg e Charité-Universitätsmedizin Berlin – il progetto di ricerca è 100 volte più grande di qualsiasi omica spaziale esistente set di dati. Si prevede che altre organizzazioni si uniranno allo sforzo nei prossimi mesi.

Secondo i partner, i dati verranno generati da circa 7.000 pazienti affetti da diversi tumori e potrebbero aiutare i ricercatori a comprendere meglio il cancro a livello molecolare, a caratterizzare le diverse forme di cancro in modo più accurato e a identificare nuovi bersagli che potrebbero eventualmente portare a nuove terapie migliorate. . I progetti attuali coinvolgono tipicamente meno di 50 pazienti.

"Credo che l'omica spaziale combinata con l'intelligenza artificiale sia il catalizzatore per guidare la prossima rivoluzione nella ricerca sul cancro", ha affermato l'amministratore delegato di Owkin, Thomas Clozel, in un post su LinkedIn. "Combinando i geni con i tessuti e il tumore con il microambiente, consente scoperte sui dati dei pazienti che gli studi sulle linee cellulari non potrebbero cogliere."

Un obiettivo chiave del consorzio nelle prime fasi sarà quello di sviluppare standard per governare il modo in cui i dati omici spaziali dovrebbero essere analizzati e confrontati, nella speranza di creare un manuale comune per i gruppi di ricerca che operano in questo settore. La speranza è che, col tempo, i dati standardizzati e i metodi di generazione e analisi dei dati siano resi accessibili alla comunità biomedica globale, per accelerare la ricerca in questo settore.

MOSAIC si concentrerà inizialmente sui tumori con esigenze mediche insoddisfatte, tra cui il cancro del polmone non a piccole cellule, il cancro al seno triplo negativo, il linfoma diffuso a grandi cellule B, il cancro ovarico, il glioblastoma, il mesotelioma e il cancro della vescica, hanno affermato i partner.